Meilleur logiciel de facturation : Guide comparatif 2025

Qu’est-ce qu’un logiciel de facturation ?

Un logiciel de facturation est un outil numérique conçu pour faciliter l’édition, l’envoi et le suivi des documents commerciaux des entreprises tels que les devis et les factures. Il est particulièrement utile pour les entreprises qui souhaitent réduire les erreurs humaines et gagner du temps dans la gestion de leur activité.

En plus de générer des documents clairs et personnalisés, un bon logiciel de facturation propose plusieurs fonctionnalités clés comme :

• La création et la gestion de devis et de factures ;

• Le suivi des paiements ;

• L’automatisation de la relance des impayés ;

• La gestion de la base clients.

Bon à savoir

Grâce à des fonctionnalités avancées, certains outils de facturation en ligne, comme Pennylane, peuvent également accompagner la croissance de l’entreprise : du premier devis jusqu’au pilotage global de la comptabilité.

Les critères de comparaison à analyser

Bien choisir votre logiciel de facturation est essentiel pour gagner du temps sur les tâches administratives, optimiser la gestion comptable et piloter efficacement votre activité.

Le choix du logiciel dépendra des besoins spécifiques de votre entreprise en fonction de sa taille et de son secteur d’activité. Afin de comparer et de choisir le bon outil, il est important d’évaluer plusieurs critères : 

1. La facilité d’utilisation Un bon logiciel doit être intuitif, avec une interface claire, ergonomique et rapide à prendre en main. Cela permet un gain de temps immédiat.

2. Les fonctionnalités disponibles Questionnez-vous sur les besoins spécifiques de votre entreprise, notamment en termes de personnalisation des documents, de suivi des paiements, de gestion client, d’intégration comptable ou de connexion à un compte bancaire. 

3. Le coût Certains logiciels sont gratuits, d’autres nécessitent un abonnement mensuel ou annuel. Comparez les prix en fonction des fonctionnalités proposées, du nombre d’utilisateurs inclus et des éventuels frais cachés.

4. La conformité légale Veillez à ce que le logiciel respecte les obligations légales françaises comme la TVA, la conservation et la sécurisation des données, la numérotation des factures, et surtout la conformité avec la future réforme de la facture électronique.

5. Le support client Un service client de qualité peut faire toute la différence en cas de problème technique. Privilégiez les solutions avec un support réactif par téléphone, chat ou email, et des ressources pédagogiques accessibles (tutoriels, centre d’aide, webinaires, etc.).

À noter : Un logiciel performant doit s’intégrer avec vos autres outils (CRM, banque, logiciel comptable, e-commerce…) pour fluidifier la gestion de votre activité et automatiser un maximum de tâches chronophages.

Comparatif de 5 meilleurs logiciels de facturation en 2025

Nous avons sélectionné 5 logiciels de facturation, gratuits ou payants, qui figurent parmi les plus fiables et les plus populaires en 2025 :

• Pennylane

• Indy

• Henrri

• Facture.net 

• Evoliz

Le logiciel de facturation Pennylane 

Pennylane est bien plus qu’un logiciel de facturation : c’est une solution de gestion financière complète, pensée pour les indépendants, les TPE, PME et les cabinets comptables. Notre outil fondé en 2020 a déjà séduit plus de 450 000 entreprises. Notre force ? Une interface ultra-ergonomique qui centralise facturation, trésorerie, comptabilité et pilotage en un seul outil connecté.

Les points forts 

• Création et envoi de factures personnalisées ; 

• Gestion des factures fournisseurs ;

• Signature électronique intégrée ;

• Rapprochement bancaire automatique ; 

• Tableau de bord financier en temps réel ;

• Partage de l’espace avec votre expert-comptable ;

• Suivi simplifié et en temps réel des paiements ;

• Compte bancaire professionnel ;

• Application mobile ;

• Conforme à la facturation électronique (émission et réception de factures électroniques sous-format Factur-X).

Préparez-vous dès maintenant pour la réforme 2026 de la facturation électronique grâce à notre solution conforme et automatisée. Pennylane est en effet une PDP (Plateforme de Dématérialisation Partenaire) reconnue et agréée par l’État. 

Fonctions avancées 

• Modules de comptabilité automatisée ;

• Gestion des notes de frais ;

• Intégration possible avec d’autres outils.

Prix 

• À partir de 14 €/mois pour la facturation 

• Dès 79 €/mois pour le logiciel de facturation + le module complet de comptabilité  

• Offre sur-mesure pour les PME, les entreprises intermédiaires et les grandes entreprises

À retenir

Pennylane coche toutes les cases : design soigné, fonctionnalités puissantes, service client réactif, sécurité irréprochable.

Indy

Indy est un logiciel de facturation gratuit spécialement pensé pour les indépendants. Initialement conçu pour simplifier la gestion comptable des professions libérales et des freelances, il s’adresse aujourd’hui à plusieurs statuts juridiques, de la micro-entreprise à la société (SARL, SASU, SCI…).

Points forts 

• Création et personnalisation de devis et de factures en illimité ;

• Interface intuitive ; 

• Suivi des paiements en temps réel ;

• Support client réactif. 

Limites 

• Certaines fonctionnalités manquent à la version gratuite.

Prix 

• Gratuit pour toutes les fonctionnalités de facturation 

• À partir de 12 € HT/mois pour la formule Premium de comptabilité

À retenir

Indy propose une formule 100 % gratuite pour la facturation avec un design clair et toutes les fonctionnalités essentielles. C’est aussi l’un des rares outils à proposer un compte pro gratuit intégré à l’interface.

Henrri

Henrri est un logiciel de facturation gratuit qui s’adresse principalement aux micro-entrepreneurs, aux toutes petites entreprises (TPE), aux petites et moyennes entreprises (PME), mais aussi aux associations, avec un socle fonctionnel généreux. C’est l’un des rares outils à proposer autant de fonctionnalités sans publicité ni restriction d’usage.

Points forts 

• Création illimitée de devis, de factures et d’avoirs ;

• Interface ludique, intuitive et sans publicité ;

• Relance automatique des impayés ;

• Sauvegarde automatique et sécurité renforcée ;

• Conforme à la réforme de la facturation électronique.

Limites

Henrri est disponible uniquement en version desktop (pas d’application mobile). Aussi, la personnalisation des documents est limitée et l’ergonomie de l’outil est parfois un peu complexe.

Prix

• Gratuit à vie, sans limites d’utilisation

• À partir de 15 € HT/mois pour ajouter des fonctionnalités spécifiques

À retenir

Henrri est gratuit à vie, sans limitation d’utilisateurs ni plafond de documents et sans publicité. Il est aussi adapté aux associations, ce qui le distingue d’autres solutions du marché.

Facture.net 

Facture.net est un outil 100 % gratuit conçu pour répondre aux besoins des auto-entrepreneurs, des freelances et des petites structures au démarrage. Il combine les fonctionnalités classiques d’un logiciel de facturation à des outils de gestion commerciale, le tout sans abonnement. 

À la croisée entre un CRM simplifié et un logiciel de facturation, il se distingue par sa simplicité d’utilisation et une interface récemment modernisée.

Points forts

• Création et personnalisation rapide de devis et de factures ;

• Suivi des paiements, des revenus et des dépenses ;

• Paiement en ligne possible pour les clients ;

• Conforme à la loi TVA et facture électronique.

Limites 

Le logiciel Facture.net est très peu personnalisable et manque parfois de fonctionnalités comme par exemple les mentions automatiques. De plus, il n’existe pas d’application mobile et le logiciel ne dispose d’aucun service client.

Prix 

Gratuit 

À retenir

Facture.net est totalement gratuit et sans abonnement, avec un nombre illimité de factures et de devis, et des fonctionnalités souvent réservées aux versions payantes d'autres logiciels.

Evoliz

Evoliz est un logiciel de facturation français pensé pour les TPE, PME et artisans en quête d’un outil complet de gestion commerciale, de facturation et de comptabilité. Véritable boîte à outils en ligne, Evoliz va bien au-delà de la simple édition de factures, avec un haut niveau de personnalisation, de sécurité et de conformité.

Points forts

• Création de devis et de factures illimités, conformes à la norme Factur-X ;

• Signature électronique intégrée ;

• Suivi des paiements et relance des impayés ;

• Suivi des stocks et gestion des fournisseurs ;

• Application mobile disponible.

Limites

Evoliz est un logiciel  assez long à configurer lors de la première génération de facture.  À noter également qu’il n’y a pas de pré-remplissage de déclaration de TVA.

Prix 

• 4 formules disponibles : de 16 € à 44 € par mois

• Offre personnalisée sur rendez-vous 

À retenir

Evoliz est doublement certifié NF203 & NF525 par l’AFNOR, ce qui garantit une conformité rigoureuse à la législation anti-fraude. Le logiciel est également hébergé en France, gage de souveraineté des données.

Tableau comparatif des logiciels de facturation

Quel logiciel de facturation choisir en 2025 ?

Le choix du meilleur logiciel de facturation dépend de plusieurs facteurs : taille de votre entreprise, secteur d'activité, volume de factures, besoin d'automatisation et de suivi comptable.

Vous êtes une TPE ou une PME en croissance ?

Si vous cherchez une solution robuste, capable d’évoluer avec votre entreprise, Pennylane s’impose comme un choix stratégique. C’est bien plus qu’un simple logiciel de facturation : il centralise la facturation, la comptabilité, la gestion de trésorerie et la collaboration avec l’expert-comptable dans une interface fluide et moderne. En tant que PDP, ce logiciel est aussi parfaitement conforme à la réforme de la facturation électronique prévue entre 2026 et 2027.

De son côté, Evoliz est une alternative solide, particulièrement appréciée pour ses nombreuses intégrations (comptabilité, achats, gestion bancaire) et son application mobile.

Vous êtes freelance ou profession libérale ?

Conçu spécifiquement pour les indépendants, Indy est idéal pour les professions libérales et les freelances qui souhaitent une solution simple à prendre en main, tout en bénéficiant d’un outil capable de gérer la facturation et la comptabilité. Il automatise un grand nombre de tâches (déclarations fiscales, suivi des dépenses, TVA, etc.) et vous permet de rester concentré sur votre cœur de métier.

Vous avez un petit budget ou commencez votre activité ?

Pour les entrepreneurs qui débutent ou qui cherchent une solution gratuite sans faire de compromis sur la qualité, Henrri est un excellent point de départ. Ce logiciel propose un éventail de fonctionnalités très complet pour un outil 100 % gratuit : création de devis et de factures avec l’ensemble des mentions obligatoires, relances automatiques, gestion des avoirs, conformité à la loi anti-fraude... Seule limite : il n’intègre pas la comptabilité et le support client est limité.

Autre option intéressante : Facture.net. Sa version gratuite est intuitive et particulièrement adaptée aux indépendants qui souhaitent émettre rapidement des factures claires et modernes, sans se perdre dans des fonctionnalités avancées. En revanche, les possibilités de personnalisation et d’automatisation sont moindres que chez ses concurrents.

Bon à savoir

Vérifiez toujours la compatibilité du logiciel avec votre expert-comptable ou les obligations fiscales à venir (notamment la facturation électronique obligatoire).

FAQ - Questions fréquentes sur les logiciels de facturation 

Est-il obligatoire d’utiliser un logiciel de facturation ?

L’utilisation d’un logiciel de facturation n’est pas encore strictement obligatoire pour toutes les entreprises. Cependant, elle est vivement recommandée pour garantir la conformité aux exigences fiscales, particulièrement la loi anti-fraude à la TVA. 

Avec la mise en place progressive de la facturation électronique obligatoire entre 2026 et 2027, l’utilisation d’un logiciel conforme deviendra incontournable pour la majorité des entreprises.

Peut-on avoir deux logiciels de facturation ?

Il est techniquement possible d’utiliser deux logiciels de facturation. Toutefois, cela peut engendrer une gestion plus complexe, avec des risques de doublons ou de pertes d’informations. Pour une meilleure organisation et une vision claire de votre activité, il est recommandé de centraliser la facturation dans un seul outil.

Quel est le meilleur logiciel gratuit de facturation ?

Henrii est souvent cité comme le logiciel de facturation le plus complet en version gratuite. Pour les débutants ou les indépendants recherchant une interface simple, Facture.net constitue également une bonne alternative.

Les points-clés à retenir 

• Pennylane est un outil tout-en-un conforme à la facturation électronique obligatoire 2026.

• Le meilleur logiciel de facturation dépend de vos besoins : taille d'entreprise, budget, conformité.

• La facilité d'utilisation et la richesse des fonctionnalités sont essentielles.

• N'oubliez pas d'anticiper les obligations légales à venir en termes de factures électroniques.

• Un bon support client peut faire la différence dans le choix final.